À medida que os cuidados de saúde se tornam cada vez mais digitalizados, cientistas, médicos e pesquisadores devem tentar interpretar quantidades sem precedentes de dados para personalizar adequadamente os cuidados. O excesso de informação disponível para esses especialistas geralmente excede sua capacidade de consumi-la e analisá-la. AmazonasA unidade de nuvem da tem trabalhado para preencher essa vácuo.
A Amazon Web Services introduziu recentemente a disponibilidade universal do Amazon Omics, que ajuda os pesquisadores a armazenar e indagar dados ômicos, uma vez que DNA, RNA e sequências de proteínas. O serviço fornece aos clientes a infraestrutura subjacente de que precisam para entender o big data, para que possam passar mais tempo fazendo novas descobertas científicas.
A AWS gera uma parcela significativa da receita da Amazon e gerou US$ 20,5 bilhões no terceiro trimestre. O negócio de computação em nuvem se expandiu para a espaço da saúde e, embora a AWS não divulgue previsões de receita para serviços específicos, o tamanho do mercado global de estudo de dados genômicos deve atingir US$ 2,15 bilhões até 2030, de congraçamento com um relatório da Straits Research.
dr Taha Kass-Hout, diretor médico da AWS, disse que a grande maioria dos dados de saúde é inerentemente desestruturada, o que significa que murado de 97% deles não são utilizados. Indexar e entender essas informações é um repto, mormente quando os pesquisadores estão coletando dados ômicos de dezenas de milhares de pacientes.
Antes da Amazon, Kass-Hout cumpriu dois mandatos no governo do presidente Barack Obama e foi o primeiro diretor de informações de saúde da Food and Drug Administration dos EUA.
O sequenciamento de um genoma humano pode exigir de 80 a 150 gigabytes de espaço de armazenamento, disse Kass-Hout, e alguns projetos de pesquisa estão analisando petabytes e exabytes de informações genômicas.
“Você está falando de quase nove valores de Harry Potter se quiser imprimi-lo em uma impressora”, disse Kass-Hout à CNBC. “E isso é somente para uma pessoa.”
O Amazon Omics ajuda os pesquisadores a organizar seus dados, fornecendo-lhes três componentes que podem ser usados individual ou coletivamente. O armazenamento de objetos habilitado para Omics ajuda os pesquisadores a armazenar e compartilhar dados brutos de sequência; Omics Workflows ajuda a executar fluxos de trabalho que processam dados brutos de sequência em graduação; e o Omics Analytics simplifica a saída do processamento de sequência.
Mais de uma dúzia de clientes e parceiros testaram uma versão beta do serviço e já estão usando o Amazon Omics.
Para Jeffrey Pennington, diretor de informática de pesquisa do Hospital Infantil da Filadélfia, o impacto já está sendo sentido.
Pennington trabalha no Departamento de Biomedicina e Informática em Saúde, que usa dados e tecnologia para resolver problemas de saúde infantil. Ele disse que o departamento passou cinco anos expandindo a infraestrutura para indagar dados ômicos e agora eles não precisam construí-los ou mantê-los sozinhos.
“Somos um grande meio médico acadêmico pediátrico, mas ainda não somos grandes o suficiente para aprender e erigir tudo o que é necessário para usar dados ômicos de forma produtiva”, disse Pennington. “Nosso tempo e força, nossos esforços e nossos recursos financeiros são muito mais muito gastos montando o quebra-cabeça do que criando essas peças em primeiro lugar.”
A Amazon Omics também incentiva a colaboração entre grandes grupos de pesquisa, grupos clínicos menores e empresas farmacêuticas e de perceptibilidade, disse Boris Oklander, cofundador e diretor de tecnologia da C2i Genomics.
A C2i é uma empresa de biotecnologia que trabalha para usar dados genômicos para desenvolver tratamentos personalizados para o cancro. Oklander disse que a empresa participou da versão beta do Amazon Omics depois de tentar desenvolver sua própria tecnologia de estudo de dados.
Ele disse que a Amazon Omics criou um ecossistema colaborativo que elimina a premência de pesquisadores criarem uma tecnologia complexa do zero.
“Estamos somente democratizando”, disse ele. “Esse tipo de serviço é alguma coisa que possibilita [us] para desbloquear o valor dos investimentos que diferentes players estão fazendo neste espaço.”
Outras grandes empresas de tecnologia desenvolveram ferramentas semelhantes. MicrosoftA plataforma de computação em nuvem Azure da Microsoft introduziu o Microsoft Genomics em 2018 para ajudar os pesquisadores a interpretar os dados gerados pelas tecnologias genômicas. GoogleA tecnologia Cloud Life Sciences também permite que os pesquisadores processem dados biomédicos em graduação.
Pennington disse que o Broad Institute e o DNAnexus também oferecem serviços populares de estudo de dados genômicos, mas disse que são difíceis de manter e podem indagar menos tipos de dados do que o Amazon Omics.
Dada a natureza sensível e profundamente pessoal dos dados da Omic, Kass-Hout disse que a proteção de dados e a proteção de dados do paciente é “tarefa zero” para a AWS. Ele disse que a AWS usa mais de 300 serviços de segurança, conformidade e governança e oferece suporte a 98 padrões de segurança e certificações de conformidade. Ao fazer isso, a AWS vai “muito além” da conformidade regulatória, disse Kass-Hout, e também disponibiliza recursos de melhores práticas e ferramentas de criptografia para seus clientes.
Os clientes também são responsáveis por gerar aplicativos seguros sobre os serviços Amazon Omics que impedem que a AWS veja ou use os dados.
Kass-Hout disse que o objetivo final do Amazon Omics é indexar informações com eficiência para que os pesquisadores possam se concentrar em fazer avanços reais na medicina de precisão.
“Se a última dez foi sobre a digitalização do setor de saúde e ciências da vida, acredito firmemente que a próxima dez será sobre a compreensão desses dados de uma forma que agora é [where] Podemos encontrar novas terapêuticas, novos diagnósticos e terapias mais direcionadas”, disse ele.
